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A Network Partition Algorithm for Mining Gene Functional Modules of Colon Cancer from DNA Microarray Data

摘要Computational analysis is essential for transforming the masses of microarray data into a mechanistic understanding of cancer. Here we present a method for finding gene functional modules of cancer from microarray data and have applied it to colon cancer. First, a colon cancer gene network and a normal colon tissue gene network were constructed using correlations between the genes. Then the modules that tended to have a homogeneous functional composition were identified by splitting up the network. Analysis of both networks revealed that they are scale-free.Comparison of the gene functional modules for colon cancer and normal tissues showed that the modules' functions changed with their structures.

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作者单位 Institute of Artificial Intelligence and Robotics, School of Electronic Information & Control Engineering, Beijing University of Technology, Beijing 100022, China [1]
栏目名称
发布时间 2007-04-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(60234020)
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