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3D Genome Tuner: Compare Multiple Circular Genomes in a 3D Context

摘要Circular genomes, being the largest proportion of sequenced genomes, play an important role in genome analysis. However, traditional 2D circular map only provides an overview and annotations of genome but does not offer feature-based comparison. For remedying these shortcomings, we developed 3D Genome Tuner, a hybrid of circular map and comparative map tools. Its capability of viewing comparisons between multiple circular maps in a 3D space offers great benefits to the study of comparative genomics. The program is freely available(under an LGPL licence)at http://sourceforge.net/projects/dgenometuner.

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DOI 10.1016/S1672-0229(08)60043-1
发布时间 2010-01-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
the National High-Tech R&D Program ((863 Program) of China (Grant No. 2006AA02A301))
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基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)

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