换一批
换一批马铃薯（Solanum tuberosum L.）全基因组水平上LTR-逆转座子的鉴定与进化分析
Genome-wide Identification and Evolutionary Analysis of LTR-retrotrans-posons in Potato
摘要LTR-逆转座子是构成基因组特别是植物基因组的重要组分。它们在寄主基因组的进化过程中起到重要作用。马铃薯是重要的经济作物和粮食作物，其全基因组序列的公布为进一步研究其遗传组成和演化提供了基础。本文以马铃薯全基因组序列为材料，用结构分析和同源比对的方法分离得到9318个完整的LTR-逆转座子，7281个非完整(truncated) LTR-逆转座子元件和3657个solo LTR元件。进一步研究表明， gypsy类转座子在距今两百万年(million years ago, MYA)时转座活性被抑制，而copia类元件活跃至今。马铃薯和番茄比较基因组学的研究表明，LTR-逆转座子序列变异率为18.73%，远高于基因序列的7.37%和CDS序列的5.01%。
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栏目名称
研究报告
DOI
10.3969/gab.032.000734
发布时间
2014-01-22
基金项目
江苏省农业科技自主创新基金(CX
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