换一批尘螨变应原Der f6、Der p6和Blo t 6结构的比较研究
Structure Comparation of the Dust Mite Allergen Der f 6、Der p 6 and Blo t 6
摘要使用ProtParam、PROSITE、Jpred、Modeller 9.12和ABCpred等生物信息学工具来预测、比较分析尘螨变应原Der f6、Der p 6和Blot 6的理化性质、一级结构、二级结构、三级结构及抗原表位.Der f 6、Der p 6和Blo t 6氨基酸序列一致性为78.35％,都含有3个胰蛋白酶活性位点氨基酸及2个功能结构区特异性序列;二级和三级结构中都由α-螺旋、β-折叠和无规卷曲组成;活性位点氨基酸在三级结构中完全重合,并相互靠近构成蛋白酶的活性中心;主要潜在抗原表位区域为4～5个,并在第37～38 aa和第175～179 aa区域出现了重合,但表位重合区的氨基酸种类不完全相同.本研究应用生物信息方法预测和比较了Der f 6、Der p 6和Blo t 6结构与抗原方面的信息,为进一步研究变应原功能、疫苗研制奠定了基础.
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DOI
10.13417/j.gab.033.000761
发布时间
2014-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
本研究由国家自然科学基金面上项目（(No.NSFC31272369)）
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