换一批拟南芥和水稻非特异脂质转运蛋白的分子进化、表达模式以及在花药发育中的功能分析
Evolutionary and Expression Profile Analysis of the Non-specific Lipid Transfer Proteins Genes Superfamily in Arabidopsis thaliana and Rice(Oryza sativa)
摘要植物非特异脂质转运蛋白(non-specific lipid transfer proteins,nsLTPs)是一类小分子碱性蛋白,该蛋白家族在植物的角质蜡质形成、信号转导以及生殖发育等方面发挥了重要的功能.目前植物中已经克隆出几十个nsLTPs基因并对它们开展了初步的功能研究,但对该基因家族在拟南芥和水稻中的基本信息、分子进化、表达模式和功能预测方面进行系统对比的数据仍很欠缺.本研究尝试利用生物信息学的方法,通过对比分析45个拟南芥和49个水稻nsLPs基因的亚家族分类、基因复制、蛋白结构、表达模式和功能预测等信息,初步阐明nsLTPs基因家族在单双子叶中可能存在的进化、表达模式和功能上的差异.同时以花药发育过程为例,细致分析了nsLPs不同亚家族基因在花药发育过程中表达水平的变化,从而推测各个亚家族蛋白在花药发育不同时期的功能.本研究以期为nsLTPs将来在植物育种和遗传学中的应用研究提供理论基础.
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DOI
10.13417/j.gab.034.001510
发布时间
2015-09-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
本研究由国家自然科学基金面上项目（(31000593,31370026和J1210047)）
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