换一批竹黄菌Ku70基因全长克隆及序列分析
Cloning and Sequence Analysis of the Full Length Ku70 DNA in Shiraia bambusicola P.Hennings
摘要为构建竹黄菌高效敲除载体,以利于竹黄菌基因功能及竹黄菌与寄主竹子之间的相互关系的研究,利用RT-PCR (reverse transcriptase-PCR)及RACE (rapid amplification of cDNA ends)技术克隆获得Ku70基因全长序列,命名为sKu70.序列分析显示:该序列基因全长为2 306 bp,开放阅读框长度为l 974 bp,编码657个氨基酸,分子质量为73.940 5 kD,理论等电点pI为5.58;序列同源性分析表明:该基因序列和预测的蛋白序列与小麦叶枯病菌SN 15 (Phaeosphaeria nodorum SN 15)的Ku70 mRNA序列(XM_001803174.1)及ATP依赖的DNA解旋酶亚基Ⅱku70 (Q0U5F2.1)同源性最高,identity分别75％和78％.二级结构预测表明Ku70蛋白α-螺旋(alpha helix)占36.99％,延伸链(extended strand)占17.05％,无规卷曲(random coil)占36.23％;包含一个Ku-core domain、一个Von Willebrand factor type A(vWA) domain和一个SAP domain,为亲水蛋白;并利用同源模建的方法预测了其三级结构.
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DOI
10.13417/j.gab.034.002593
发布时间
2016-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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