换一批黄花苜蓿SKIP同源基因cDNA的克隆与生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of SKIP Homologous Gene cDNA from Medicago falcata L.
摘要本研究利用RT-PCR方法从野生黄花苜蓿中克隆得到一个编码pre-mRNA剪切因子SKIP同源基因的cDNA片段,命名为MfSKIP.对克隆片段的序列分析表明,该cDNA片段全长2256 bp,包含一个1 836 bp的开放阅读框,预测编码一条含61 1个氨基酸的多肽,分子量约为69.1 kD,理论等电点8.78.对蛋白保守结构域的分析显示MfSKIP具有SNW/SKIP蛋白特有SKIP的S-N-W-K-N序列,与水稻SKIP (NP_001048184.1)同源性高达85％.生物信息学分析表明,MfSKIP属于定位在细胞核内的不含跨膜结构域且不含信号肽的亲水性蛋白,二级结构主要由无规则卷曲结构组成.系统发育分析表明,野生黄花苜蓿MfSKIP蛋白与蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)的MtSKIP、鹰嘴豆(Cicer arietinum) CaSKIP亲缘关系较近.本研究成功克隆野生黄花苜蓿MfSKIP基因全长cDNA片段,为研究pre-mRNA剪切因子在黄花苜蓿响应非生物逆境胁迫应答中的作用奠定基础,并为抗逆牧草新品种培育提供候选基因.
更多相关知识
关键词
黄花苜蓿pre-mRNA剪切因子MfSKIP基因生物信息学分析Medicago falcata L.Splicing factorMfSKIP geneBioinformatics analysis
栏目名称
DOI
10.13417/j.gab.035.002794
发布时间
2016-12-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（31101762）
内蒙古自治区自然科学基金（2013MS0508）
- 浏览12
- 被引5
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
