换一批
换一批羽叶三七的转录组测序与三萜皂苷生物合成的关键酶基因的识别
Transcriptome Sequencing of Panax pseudoginseng and Identification of Key Enzyme Genes in Triterpenoids Saponin Biosynthesis
摘要羽叶三七是五加科人参属的名贵药材,三萜皂苷为羽叶三七最主要的活性成分.为了探索羽叶三七根茎中皂苷物质生物合成的分子基础,采用Illumina HiSeq 2000高通量测序获得羽叶三七根茎的转录组数据;使用Trinity和TGICL软件实现UniGene的de novo拼接;基于BLAST完成UniGene的蛋白功能注释、KOG功能注释、GO分类和KEGG代谢通路分析.最终通过de novo拼接注释得到UniGene 62 240个.研究发现,羽叶三七根茎部表达的26个UniGene与三萜碳环骨架合成相关;三萜合成通路中的关键酶FPS、SS、SE等,分别有11 114个UniGene.该研究发现的三萜皂苷合成相关候选基因对于阐明羽叶三七三萜皂苷合成方式研究提供了理论基础.
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关键词
羽叶三七转录组测序三萜合成关键酶Panax pseudo-ginsengTranscriptome sequencingKey enzymes of triterpenoid saponin synthesis
栏目名称
DOI
10.13417/j.gab.036.002531
发布时间
2017-07-27
基金项目
国家自然科学基金（81274023）
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