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接头蛋白复合体AP2B1基因的克隆与分析

Cloning and Analysis of AP2B1 Gene of Adaptor Protein Complex

摘要泽漆 (Euphorbia helioscopia L.) 为大戟科 (Euphorbiaceae) 大戟属 (Euphorbia) 一年生或两年生草本植物, 整棵植株含乳汁.作为一种古老的民间草药, 泽漆的主要药用成分存在于乳汁中.因此, 研究乳汁管的发育可为泽漆乳汁中药用成分的合成、积累和转运提供理论依据.AP-2B1是接头蛋白复合体2 (AP-2) 的beta-型亚基.我们通过前期的研究发现, AP-2B1可能在泽漆乳汁管发育过程溶酶体酶的分拣和转运中有重要的作用.为此, 我们采用RACE技术从泽漆中分离克隆出AP-2B1基因, 序列全长3 176 bp, 命名为Eh AP-2B1 (登录号:KP995937).再利用NCBI网站及生物信息学软件对其进行分析, Eh AP-2B1基因编码903个氨基酸, 蛋白相对分子量为100.37 k D, 等电点为5.10.Eh AP-2B1基因编码的蛋白属于亲水性蛋白, 具有3个保守区域.通过氨基酸序列比对, Eh AP-2B1蛋白与麻风树 (Jatropha carcas) 的AP-2B1蛋白相似度达到100%, 与可可树 (Theobroma cacao) 、甜橙 (Citrus sinensis) 的相似度达到99%.根据系统进化树的分析结果表明, 泽漆AP-2B1蛋白与蓖麻 (Ricinus communis) AP-2B1蛋白的亲缘关系最近, 与麻风树的AP-2B1蛋白平行进化.通过对该蛋白二级结构预测分析显示, 多肽链中α-螺旋 (α-helix) 最多, 占45.63%, 其次为无规则卷曲 (random coil), 占31.56%, 最后为延伸链 (extended strand) 和β-转角 (β-turn), 分别占17.17%和5.65%.此研究结果为后期进行乳汁管发育与调控的研究提供理论依据.

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作者 柴佳 [1] 苗燕 [1] 蔡霞 [1] 学术成果认领
DOI 10.13417/j.gab.037.003909
发布时间 2018-11-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(31270220)
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基因组学与应用生物学

基因组学与应用生物学

2018年37卷9期

3909-3918页

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