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苔藓NAC基因家族的生物信息学分析

Bioinformatics Analysis of NAC Gene Family in Bryophytes

摘要NAC(NAM,ATAF,CUC)转录因子家族仅存在于陆生植物中,在植物发育、响应胁迫以及生物合成过程中发挥重要作用.许多NAC家族成员的功能已被确定(主要在模式植物中),但在苔藓等早期陆生植物中NAC家族的进化过程尚不清楚.本研究从藓类的小立碗藓(Physcomitrella patens)和泥炭藓(Sphag-numfallax)、苔类的地钱(Marchiantia polymorphia)和角苔类的角苔(Anthoceros angustus)中,共鉴定出97个NAC基因,并对其进行NAC转录因子家族进化分析.藓类有大约40个NAC基因,地钱和角苔中只有大约10个NAC基因.在苔藓植物中,NAC基因家族可分为5个亚家族.基因结构和保守结构域分析表明,在同一个亚家族中,大多数NAC基因具有相似的基因结构和编码相似的蛋白基序.共线性分析表明NAC-Ⅱ基因位于藓类植物保守共线性区,并随着藓类植物的整个基因重复事件而扩张.上述研究结果表明NAC基因的扩张不仅发生在维管植物中,也发生在苔藓植物中,这对NAC基因家族的功能扩展是至关重要的.进一步研究结果显示,NAC基因家族的扩增时间与藓类植物的全基因组复制(whole genome duplication,WGD)事件密切相关,说明NAC基因家族伴随着全基因复制事件发生扩张.

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