换一批
换一批基于全长转录组测序挖掘中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)性腺发育相关基因
Transcriptome Sequencing for Gonadal Development-related Genes in Sea Urchin Strongylocentrotus intermedius )
摘要中间球海胆(Strongylocentrotus intermedius)是一个重要的海水养殖品种,性腺是其唯一可食用的部分.海胆产业季节性强,若能人工控制其性成熟将具有重要的经济价值.本研究对处于营养噬细胞(nutri-tive phagocyte,NP)恢复期的中间球海胆精巢及卵巢进行全长转录组测序,以期挖掘参与其性别决定、性别分化和配子发生相关的基因.通过从头组装(de novo)获得64949条Unigenes,通过同源比对分析共注释了23848个(36.72％)功能基因.通过比较精巢及卵巢中Unigenes的表达水平,获得了15985个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs).与精巢相比,卵巢中8355个DEGs显著上调,7630个DEGs显著下调.利用GO聚类分析、 差异基因表达分析等鉴定了14个精巢特异表达基因(DMRT1、Catspere、Meioc等),16个卵巢特异表达基因(TGFBI、EGF3、EGF1等)和19个进化上保守的性别相关基因(Spata4、DMC1、HSF5、gata4等).本研究为解析中间球海胆性腺发育机制奠定了基础.
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DOI
10.13417/j.gab.041.002062
发布时间
2023-04-21
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