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水牛卵泡不同发育阶段差异表达基因分析

Analysis of Differentially Expressed Genes in Follicles of Bubalus bubalis at Dif-ferent Developmental Stages

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摘要本研究旨在利用转录组测序技术探究摩拉水牛(Bubalus bubalis)发情期不同大小卵泡的基因表达谱,并进一步了解其对卵泡发育过程中相关激素的影响.通过对摩拉水牛进行Ovsynch法同期发情处理,B超检测卵泡大小并按照大、中、小3种类型(＞8mm、4～7mm、0～3 mm)区分,活体采集卵泡液后提取RNA送单细胞转录组测序.将获得的数据进行组间两两比较,以|log2fold change|≥ 1且P＜0.05为标准筛选差异转录本,并取各组差异表达转录本并集共1 473个转录本做表达趋势筛选,其中587个转录本符合牛卵泡发育过程中的转录调控规律,通过GO和KEGG富集分析并筛选得到了 33条通路,各通路主要与细胞间相互作用、类固醇生成和激素产生、细胞分化和发育、细胞运动、代谢调节、生理适应性等过程相关.通过对通路上的基因进行蛋白质互作网络分析,进一步获得了可能影响水牛卵泡发育过程中激素调节的关键基因,如BAMBI、FST、INHA、INHBA、INHBB、G4TA6和GFAP.综上,该研究结果为进一步探究水牛卵泡发育过程中的关键基因及可能的分子调控机制提供了参考.

作者徐晓晛 ^[1] 蒋晗偲 ^[1] 李志鹏 ^[1] 崔奎青 ^[2] 罗西尔 ^[2] 杨春艳 ^[3] 刘庆友 ^[4] 学术成果认领

作者单位广西大学动物科学技术学院,南宁,530004 ^[1] 佛山科学技术学院生命科学学院,佛山,528225 ^[2] 中国农业科学院广西壮族自治区水牛研究所广西水牛遗传繁育重点实验室,南宁,530004 ^[3] 广西大学动物科学技术学院,南宁,530004;佛山科学技术学院生命科学学院,佛山,528225 ^[4]

关键词水牛(Bubalus bubalis)卵泡大小卵母细胞激素调节转录组测序 Buffalo(Bubalus bubalis)Follicle size Oocyte Hormone regulation Transcriptome sequencing

栏目名称

研究论文

DOI 10.13417/j.gab.043.000853

发布时间 2024-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

基金项目

广西科技重大专项（AA22068099）广西自然科学基金项目（2021GXNSFAA196021）国家自然科学基金（U20A2051）