基于SSR分子标记探索贵州省黔西南州杜仲遗传多样性
Exploring the Genetic Diversity of Eucommia ulmoides in Qianxinan Prefecture,Guizhou Province Based on SSR Molecular Markers
摘要杜仲(Eucommia ulmoides)是一种源自中国且具有2 000多年历史的药用树种.贵州省黔西南州杜仲种质资源的收集和利用受到资料缺乏制约.为解决这一问题,本研究初步评估黔西南州和贵阳市的杜仲种质资源的表型多样性,并使用10对基因组多态性简单重复序列(simple sequence repeated,SSR)和5对转录组多态性SSR评估种质资源的遗传多样性.结果显示,62份种质资源具有较高的叶色多样性和遗传多样性.进一步进行分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)发现,75%的变异存在于个体之间.在种群结构分析中可将不同类群划分为3个不同聚类,与主成分分析(principal compo-nent analysis,PCA)结果基本吻合.利用非加权组平均法(unweighted pairgroup method with arithmetic mean,UPGMA)和算术平均树形图构建杜仲系统进化树,可将供试材料划分为4个类群,与地理来源高度一致.综上,本研究成功利用SSR标记分析黔西南州杜仲种质资源的遗传多样性,为该地区种质资源的合理保护和收集提供一定的参考价值.
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