基于线粒体Cytb及CO Ⅰ基因的黄河上游大鼻吻鮈(Rhinogo-bio nasutus)遗传多样性与系统发育关系分析
Genetic Diversity and Phylogenetic Relationship of Rhinogobio nasutus in the Up-per Reaches of the Yellow River Based on Mitochondrial Cytb and CO Ⅰ Genes
摘要为研究黄河上游不同群体大鼻吻鮈遗传结构与系统发育关系,保护其野生种质资源,本研究基于线粒体Cytb和CO J基因对黄河宁夏段及内蒙古段4个地理群体的大鼻吻进行了遗传多样性及系统发育关系分析.结果表明,Cytb和COⅠ基因序列长度分别为1 145、749 bp,两个序列串联后的组合序列长度为1 894 bp,碱基组成均呈现明显的AT偏倚性.4个地理种群中,线粒体Cytb和CO Ⅰ序列具有8个组合多态位点及9个组合单倍型,平均单倍型多样性(ffd)0.776,平均核苷酸多样性(π)为0.000 78.分子方差分析(analysis of molecular variance,AMOVA)显示4个地理种群间无显著遗传分化,其中95.81%变异来自群体内部,4.18%变异来自群体间.系统发育树及单倍型网络图表明大鼻吻鮈遗传结构比较单一,错配分布结果表明大鼻吻鮈在历史上出现过群体扩张事件.综上所述,黄河中上游的大鼻吻鮈群体遗传结构单一、遗传多样性较低,有必要将其作为一个保护单元进行就地保护,以期丰富大鼻吻鮈种群的遗传多样性.
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