换一批
换一批基于RNA-seq技术分析活性氧对未成熟树突状细胞迁移能力的促进作用
Analysis of the Promotion with Reactive Oxygen Species on Migration of Imma-ture Dendritic Cells Based on RNA-seq Technique
摘要本研究在检测未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,imDCs)响应胞外活性氧(reactive oxygen species,ROS)后的细胞周期和迁移能力基础上,通过RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术分析差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),探索ROS促进imDCs迁移的潜在机制.利用H2O2模拟ROS构建imDCs氧化应激模型,利用CCK8法检测细胞活力,采用流式细胞术检测细胞凋亡和细胞周期变化,利用细胞实时成像实验分析imDCs的自由迁移情况.提取总RNA并进行RNA-seq,对DEGs进行GO和KEGG富集分析,按照DEGs表达变化|log2FC|≥ 1且FDR≤0.01筛选代谢及骨架调节相关转录基因.结果表明,H2O2处理浓度小于100 μmol/L时,imDCs的细胞活力和凋亡均无显著变化;imDCs在ROS环境中的细胞周期停滞在G0/G1期,且细胞的自由迁移能力增强.RNA-seq结果显示,H2O2处理组与对照组相比,共有282个DEGs,其中225个基因表达下调,57个基因表达上调.GO和KEGG分析发现这些基因参与了代谢、细胞周期和细胞骨架等相关通路,其中与异源物质代谢相关的Gsta1、Gsta3、Cstdc5和Prdx1等基因表达上调,Shmt2基因表达下调;参与骨架调节的S100a8、Ppbp和Tm4sf19等基因表达上调,而Nusap1、Stmn1、Kif20a和Prc1等基因表达下调.本研究表明,在imDCs响应胞外ROS过程中抗氧化系统激活、细胞骨架重塑与细胞周期停滞可能参与调控其迁移能力.
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关键词
活性氧树突状细胞氧化应激细胞骨架细胞迁移Reactive oxygen speciesDendritic cellsOxidative stressCytoskeletonCell migration
栏目名称
研究论文
DOI
10.13417/j.gab.043.001859
发布时间
2025-01-11
基金项目
国家自然科学基金
国家自然科学基金
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