换一批嗜黏蛋白阿克曼菌分离株全基因组及生物学特性分析
Analysis of the Complete Genome and Biological Characteristics of Akkermansia muciniphila Isolates
摘要为了解前期实验室分离的嗜黏蛋白阿克曼菌(Akkermansia muciniphila,AKK)基因及生物学特性,本研究分析了2 株人源AKK分离株(SDLYAKK5 和SDLYAKK8)的全基因组及泛基因组、生长特性、碳源利用能力、环境氧耐受能力、体外抑菌能力及代谢产物.结果表明,两分离株全长均为 2.8 Mb左右,但两者平均核苷酸相似度(average nucleotide identity,ANI)为 97.52%,表明两分离株属于不同亚种.菌株泛基因组基因有 7 284 个,核心基因有 195 个.两分离株稳定期OD600 均为1.140 左右,都可以代谢 95 种碳源中的 23 种,但SDLYAKK8 分离株的耐受环境氧气能力及抑菌能力显著高于SDLYAKK5的.同时利用非靶代谢组学技术分析了两分离株在培养基中发酵代谢产物,结果表明SDLYAKK8 分离株可以产生更多的γ-氨基丁酸、N-乙酰血清素等物质,而SDLYAKK5 可以产生更多的泛酸、米格列醇等多种功能性代谢产物.本研究结果为两分离株后续进一步的开发利用提供了数据支撑.
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关键词
嗜黏蛋白阿克曼菌全基因组泛基因组生物学特性非靶代谢组学Akkermansia muciniphilaComplete genomePan-genomeBiological characteristicsNon-targeted metabolomics
栏目名称
DOI
10.13417/j.gab.044.000281
发布时间
2025-04-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（32202810）
山东省高等学校大学生创新创业训练计划项目（X202310452397）
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