药鼠尾草转录组测序及药效物质合成关键酶基因差异表达分析
Transcriptome Sequencing and Differential Expression Analysis of Essential En-zyme Genes Involved in the Biosynthesis of Pharmacologically Active Com-pounds in Salvia officinalis
摘要药鼠尾草(Salvia officinalis)是唇形科(Lamiaceae)鼠尾草属(Salvia)多年生草本植物,含有鼠尾草属植物的特征性代谢产物——松香烷型二萜类化合物和酚酸类化合物.为了比较药鼠尾草地上(叶)与地下(根)部分不同化合物的产生模式,本研究基于高通量测序技术平台Illumina NovaSeq 6000进行了药鼠尾草叶与根的转录组测序和生物信息学分析,共获得33 850个独立基因(unigenes),其中24 343个独立基因能被公共数据库注释到.差异表达基因分析结果显示,药鼠尾草叶与根中共有13 618个基因存在显著差异表达.差异表达基因代谢途径分析发现,酚酸类生物合成通路相关基因在根中的表达显著高于叶中;而松香烷型二萜类化合物生物合成通路相关基因在根和叶中均有表达,与药鼠尾草中这两类化合物的积累模式较为一致.本研究可为进一步挖掘药鼠尾草有效成分生物合成过程中的关键基因,以及调控其药效成分生物合成奠定基础.
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