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多种癌症与重症肌无力的共享遗传基础:整合多种基因组分析方法的研究

Shared Genetic Basis Between Various Cancers and Myasthenia Gravis:An Integrative Study of Multiple Genome Analytical Methods

摘要本研究旨在利用大规模遗传数据探索多种癌症与重症肌无力(myasthenia gravis,MG)的共同遗传基础.通过整合 9种癌症和MG及其两种亚型的全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)数据,采用连锁不平衡评分回归(linkage disequilibrium score regression,LDSC)、复合零假设下的多效性分析(pleiotropic analysis under composite null hypothe-sis,PLACO)和孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)方法进行分析.结果发现,六对癌症-MG性状间存在显著遗传相关性,尤以肾癌(kidney cancer,KC)为著.共识别出 162 个多效性单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),对应 30 个独立风险基因座,功能富集分析提示,这些基因在淋巴组织中特异性表达.MR分析揭示,早发型MG(early-onset MG,EOMG)与肾癌风险负相关,而晚发型MG(late-onset MG,LOMG)与乳腺癌(breast cancer,BC)风险正相关.癌症与MG存在共享的遗传结构,为理解其共同机制和开发靶向策略提供了新见解.

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