猪半胱天冬酶基因家族鉴定及其在PPV感染PK-15细胞中的表达动态与调控网络
Identification of the Porcine Caspase Gene Family and Analysis of Its Expression Dynamics and Regulatory Networks in PPV-infected PK-15 Cells
摘要半胱天冬酶(caspase,CASP)是调控细胞凋亡与炎症反应的核心因子,猪细小病毒(Protoparvovirus ungulate1,porcine parvovirus,PPV)感染可激活猪细胞内相关信号通路并引发病理变化.本研究旨在鉴定猪半胱天冬酶基因家族,探究 PPV 感染后该家族基因的表达动态及调控机制,为解析 PPV 致病分子机制提供数据支撑.本研究以猪肾-15(porcine kidney-15,PK-15)细胞为感染模型,经系统发育分析证实,猪(Sus scrofa)CASP 基因家族与牛(Bos taurus)同源基因的进化关系相较于其他物种更为紧密.在 PPV 感染后 12、24、48、72 h 采集细胞样本进行转录组测序,相邻时间点(12 h vs 24 h、24 h vs 48 h、48 h vs 72 h)分别检测到 5 749 个、7 376 个、7 320 个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs).其中,CASP3、CASP9、CASP10 表达变化尤为显著,在感染周期中呈现显著波动.通过蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析,深入挖掘了差异表达的半胱天冬酶基因与其他DEGs 之间的相互作用关系,尤其是与凋亡通路和炎症通路相关基因的复杂调控网络,清晰揭示了各基因间的协同作用模式.本研究阐明了猪半胱天冬酶基因家族在 PPV 感染中的表达规律,解析了其参与 PPV 诱导的细胞凋亡和炎症反应的分子机制,为后续 PPV 致病机制研究提供了实验依据.
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