换一批青海"柴达木大肥菇"基因组特征与比较基因组分析
Genome Characteristics and Comparative Genome Analysis of"Chaidamu Dafeigu"in Qinghai
摘要"柴达木大肥菇"是青海省柴达木盆地盐碱荒漠生态系统的典型大型真菌,其分类归属存在争议.本研究采用 Illu-mina NovaSeq 和 PacBio Revio 测序平台,完成了"柴达木大肥菇"菌株 ASnmh513 的全基因组测序、组装及注释,并进一步与中华美味蘑菇(Agaricus sinodeliciosus)ZRL20160001-S65 开展比较基因组分析.结果显示,菌株 ASnmh513 的基因组大小为33.07 Mb,G+C 含量为 45.89%,组装获得 20 条大于 1 kb 的 contig,完整度达 94.88%.共预测到 9 268 个编码基因,其中6 668 个获得 GO 注释,8 802 个获得 KEGG 注释.系统发育分析和平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)分析表明,ASnmh513 与 ZRL20160001-S65 亲缘关系极近(ANI=0.99),构成一个高支持率的单系群.两基因组共线性支持率为73.15%,共有基因家族占比85.57%,并筛选出ASnmh513 特有基因家族1 294 个,其功能显著富集于催化活性、转录调控和发育过程等类别.本研究首次构建了"柴达木大肥菇"的高质量基因组参考图谱,从基因组层面确认其为中华美味蘑菇,同时提示其特有基因可能在盐碱环境适应和子实体发育中扮演关键角色.
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关键词
柴达木大肥菇中华美味蘑菇全基因组测序比较基因组分析特有基因Chaidamu dafeiguAgaricus sinodeliciosusWhole genome sequencingComparative genomic analysisUnique genes
栏目名称
DOI
10.13417/j.gab.045.000671
发布时间
2026-07-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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