换一批摘要麦红吸浆虫Sitodiplosis mosellana (Gehin)是一种世界性的小麦害虫.为获得其转录组信息,本研究采用新一代高通量测序技术Illumina HiSeq TM2000对麦红吸浆虫成虫转录组进行测序.共获得转录组样本数据量为27.88 G,经分析共获得59 257个Unigenes,总长度49 861 164bp,最短20 bp,最长29 282 bp,平均长度841 bp.将Unigenes序列与NR、NT、Swiss-Prot、KEGG、GO和KOG数据库进行比对(e≤10-10),共获得95 029个结果.通过GO功能分类,共有19 584个Unigenes在GO数据库中细胞组分、分子功能和生物学过程等3大类50个功能组中找到对应.与KOG数据库进行比对,共有11 279个麦红吸浆虫Unigenes被注释,按功能大致可分为26类.通过KEGG pathways分析,共有9 110个麦红吸浆虫Unigenes被注释,分别归属于细胞进程、环境信息进程、遗传信息进程、新陈代谢和有机体系统5大类代谢途径,主要包括细胞生长与死亡、细胞运动、信号转导、能量代谢等32类代谢途径.CDS预测发现30 088条序列可被编码,占全部基因的50.78％.SSR位点查找发现,在59 257个Unigenes中共找到36 323个SSR位点,发生率为61.30％.本研究获得的巨大的麦红吸浆虫转录组信息,为麦红吸浆虫的功能基因挖掘提供了重要的信息资源.
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分类号
Q963（昆虫遗传学）S433
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1674-0858.2020.01.16
发布时间
2020-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家小麦产业体系地下害虫岗位（(CARS-03)）
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