换一批
换一批桉蝙蛾幼虫实时荧光定量PCR内参基因的筛选
Screening of reference genes for RT-qPCR analysis in Endoclita signifier Walker larvae
摘要本研究通过筛选桉蝙蛾Endoclita signifer Walker幼虫不同龄期与不同体节中稳定表达的内参基因,为桉蝙蛾基因表达研究提供参考.通过实时荧光定量PCR技术测定5个候选内参基因(ACTIN、GAPDH、TUB、RIB、EF)在桉蝙蛾幼虫不同龄期(3龄、5龄、9龄、12龄)与不同体节(头部、胸部、腹部)及全样品(由所有样品组成)处理中的表达量,后利用GeNorm、NormFinder、BestKeeper对5个候选基因的稳定性进行评估,最后由RefFinder综合分析结果,选出最佳的内参基因.基于4种分析方法的评估可知,桉蝙蛾5龄和9龄幼虫的不同体节、不同龄期幼虫的头部和胸部中内参基因的最佳数目为2,而3龄和12龄幼虫的不同体节、不同龄期幼虫的腹部及全样本中内参基因的最佳数目为3.3龄、5龄、9龄和12龄幼虫的不同体节中可分别选择ACTIN+RIB+GAPDH、EF+RIB、GAPDH+EF 和 ACTIN+RIB+GAPDH 作为最稳定的内参基因组合;EF+RIB、RIB+GAPDH 和EF+GAPDH+ACTIN可分别作为不同龄期幼虫头部、胸部和腹部的最佳内参基因组合;综合考虑桉蝙蛾幼虫不同龄期与不同体节的影响时,可选择RIB、ACTIN和G4PDH作为内参基因.
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栏目名称
生理与生化
DOI
10.3969/j.issn.1674-0858.2023.04.19
发布时间
2024-05-13
基金项目
广西壮族自治区科技基地和人才专项
广西壮族自治区自然科学基金面上项目
国家自然科学基金
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