茶银尺蠖触角转录组及相关嗅觉基因的分析
Analysis of the antennal transcriptome and olfaction-related genes of Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)
摘要本研究利用IIIumina Hiseq 4000高通量测序平台对茶银尺蠖Scopula subpunctaria(Herrich-Schaeffer)雌雄成虫触角进行转录组测序,共获得93 335条unigenes,N50长度为1 151 bp.通过基因功能注释,有23 581条unigenes注释到六大公共数据库中,其中注释到NR数据库的unigenes最多,占39.96%,且与家蚕Bombyx mori相似基因数目最多,占20.32%;10718条unigenes注释到GO数据库的生物过程、细胞组分和分子功能3个大类46个亚类;5 464条unigenes注释到KEGG数据库的38个小类代谢通路,其中注释在信号传导通路的unigenes最多,占10.64%.根据注释信息,共筛选得到60个候选嗅觉基因,包含17个气味结合蛋白基因(Odorant binding protein genes,OBPs)、13 个化学感受蛋白基因(Chemosensory protein genes,CSPs)、14 个嗅觉受体基因(Olfactory receptor genes,ORs)、13 个离子型受体基因(Ionotropic receptor genes,IRs)和 3个感觉神经膜蛋白基因(Sensory neuron membrane protein genes,SNMPs).利用 FPKM 值对 SsubOBPs 和 SsubCSPs 基因进行表达量分析发现,SsubOBP2和SsubOBP3在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>2 000),SsubCSP4、SsubCSP7和SsubCSP9在茶银尺蠖雌雄成虫触角中均高丰度表达(FPKM>900).本研究首次获得了茶银尺蠖触角转录组数据,并鉴定出候选嗅觉相关基因,结果为进一步研究茶银尺蠖的嗅觉感受机制提供分子基础.
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