换一批毛囊蠕形螨与皮脂蠕形螨基因组DNA的RAPD分析和序列比对
RAPD analysis and sequence alignment of genomic DNA of hair follicle mites Demodex folliculorum and D.Brevis (Acari:Demodicidae)
摘要[目的]分析毛囊蠕形螨Demodex folliculorum (D.f) 和皮脂蠕形螨D.Brevis (D.b.)基因组DNA的多态性,对相关条带进行测序分析.[方法]采用改良小昆虫DNA提取法提取两种人体蠕形螨基因组DNA,选择RAPD技术对其进行多态性分析,将相关条带分别与pMDl8-T载体连接,克隆、测序后进行酶切鉴定和分析.[结果]毛囊蠕形螨共扩增15条带,皮脂蠕形螨共扩增12条带;两种蠕形螨既有共有条带,又有特异性条带;根据条带差异计算得到两种间的遗传距离为0.5556.毛囊蠕形螨约800 bp处特异性条带测序结果显示,序列片段长度为855 bp(GenBank登录号为F1277970);特异性引物扩增和酶切鉴定均为毛囊蠕形螨所特有.序列比对显示与阿糖胞苷DNA区域结合蛋白有46%的序列相似度.两种人体蠕形螨约300 bp处共有条带序列分析显示,碱基序列均为341 bp(GenBank登录号分别为D.f F1520176;D.b.F1520175),在第84和第165位点有2个碱基不同,分别是A/G和C/T互换,同源性高达99.4%.但未发现有开放阅读框和相似度高的序列.[结论]序列片段为855 bp的特异性条带为毛囊蠕形螨所特有;341 bp碱基序列为毛囊蠕形螨和皮脂蠕形螨所共有,同源性高达99.4%.RAPD技术可用于两种人体蠕形螨基因组DNA的多态性分析和物种鉴定.
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关键词
毛囊蠕形螨皮脂蠕形螨RAPD分析遗传距离序列比对物种鉴定Demodex folliculorumDemodex brevisRAPD analysisgenetic distancesequence alignmentspecies identification
分类号
Q966（昆虫生物化学）
栏目名称
DOI
10.3321/j.issn:0454-6296.2009.11.015
发布时间
2010-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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