菜粉蝶线粒体基因组的全序列测定和分析

Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Pieris rapae Linnaeus(Lepidoptera:Pieridae)

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摘要目前关于蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究还不多见.本研究通过长PCR和引物步移法对菜蝶Pieris rapae Linnaeus线粒体基因组全序列进行了测定和初步分析.结果表明:菜粉蝶线粒体基因组全长15 157bp,包含13个蛋白编码基因、22个tRNA和2个rRNA基因以及1个非编码的控制区域,它们的长度分别是11 196bp,1 474 bp,2 093 bp和393bp.37个基因的位置与已报道的其他蝶类基本一致,共有10对基因间存在总共59 bp的重叠,重叠碱基数在1～35bp之间;基因间隔序列共计13处120帅,间隔长度1～46 bp不等,最大的基因间隔46 bp,位于tRNA(lle)和tRNA(Gln)基因之间.另外,基于13个蛋白质编码基因的氨基酸序列,重建了基于蛋白质编码基因序列数据的11种代表性蝶类的NJ和MP系统树.结果表明:凤蝶类(包括凤蝶和绢蝶)为一大支系,粉蝶类、灰蝶类与蛱蝶类(包括蛱蝶、珍蝶)构成另一大支系.结果不支持粉蝶科与凤蝶科(包括凤蝶类和绢蝶类)构成单系群,却显示粉蝶科、灰蝶科和蛱蝶科的组合为单系群.