换一批
换一批基于转录组数据高通量发掘黄粉甲微卫星引物
High-throughput discovery of SSR genetic markers in the yellow mealworm beetle, Tenebrio molitor (Coleoptera:Tenebrionidae), from its transcriptome database
摘要黄粉虫Tenebrio molitor作为理想的模式研究生物,虽然已围绕该昆虫在多个研究领域开展了诸多研究,但是有关其分子和遗传方面的研究仍知之甚少.为此,本研究基于前期构建的黄粉甲转录组数据库,成功发掘获得1 249个微卫星序列.其中,单碱基或三碱基序重复列最多,分别占44.44％和41.15％;A/T型重复序列出现频率最高,占42.70％.除单核苷酸重复序列外,重复单元的重复次数以5次最多,占30.90％.基于鉴定获得的微卫星序列,共设计获得1 004对微卫星引物,而且每对引物还设计了5对替代引物.研究获得的微卫星引物将有助于今后开展黄粉甲功能和比较基因组学方面的研究.
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