基于mtDNA COI基因的甘肃截形叶螨不同地理种群遗传分化分析

Analysis of genetic differentiation among different geographic populations of Tetranychus truncatus (Acari: Tetranychidae) in Gansu province,northwestern China based on mtDNA COI gene

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摘要[目的]探讨甘肃截形叶螨Tetranychus truncatus种群遗传多样性、遗传分化及种群系统发育关系.[方法]本研究以2016年6-9月采自甘肃省8个不同生境的34个截形叶螨种群的518头螨样品进行mtDNA COI基因PCR扩增、测序,并利用MEGA7.0和Dna SP5.0等软件分析截形叶螨不同种群的mtDNA COI基因序列变异和遗传分化情况.[结果]在34个截形叶螨地理种群中共获得518条mtDNA COI基因片段,测定片段长度为402 bp,T,C,A和G碱基平均含量分别为43.2％,10.5％,32.2％和14.0％,A+T含量(75.4％)明显高于C+G含量(24.6％),有明显的A/T偏倚性;核酸多样性性指数为0.0328.共检出12个单倍型,单倍型指数为0.8004,其中,H2出现了14次,分布于5个生态区域,为主体单倍型,占个体样本的41％.单倍型网络中介图表明各单倍型明显聚为5个聚类簇;12个单倍型的NJ系统发育树明显地分为4支,该结果与单倍型中介网络图的结果基本一致.各种群间的遗传距离在0.001 ～0.08955之间.UPGMA聚类图结果表明JQ(酒泉)种群和HS(合水)种群与其他种群相比分化明显.Mantel检测结果表明,种群间的遗传距离与地理距离无显著的相关性(r =0.043,P＞0.05).34个种群间的遗传分化指数Fst为0.11995,种群间变异比例为1.20％.[结论]甘肃省8个生态区的34个截形叶螨种群间的遗传距离与地理距离无显著相关性;截形叶螨的遗传变异主要来自于种群内部,种群间还未发生明显的遗传分化现象.