换一批利用全长转录本优化柞蚕基因组注释
Improvement of the annotation of Antheraea pernyi(Lepidoptera:Saturniidae) genome using full-length transcripts
摘要[目的]优化柞蚕Antheraea pernyi基因组注释,更好地扩展其在比较基因组学及品种改良研究中的应用.[方法]对柞蚕进行全长转录组测序分析;经全长转录本与参考基因组比对,鉴定新基因及新转录本,并对这些新基因和新转录本进行功能注释及长链非编码RNAs (lncRNAs)预测.利用大量的蛋白质编码转录本和lncRNAs对柞蚕基因组中基因结构进行修订.最后创建矫正后的柞蚕基因组基因注释.[结果]新发现1997个蛋白编码基因和3399个lncRNA基因,分别由2402个和3574个全长转录本数据支持.发现柞蚕基因组合25021个基因,其中19825个基因是蛋白编码基因,包括7个保幼激素酸甲基转移酶基因.[结论]本研究促进了对柞蚕基因组基因注释信息的认识,为柞蚕及相关物种功能基因组及比较基因组学研究提供了很有用的数据资源.
更多相关知识
关键词
柞蚕基因组注释全长转录组蛋白编码基因lncRNA保幼激素酸甲基转移酶基因Antheraea pernyigenome annotationfull-length transcriptomeprotein-coding geneslncRNAjuvenile hormone acid O-methyltransferase genes
栏目名称
DOI
10.16380/j.kcxb.2021.11.002
发布时间
2022-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
- 浏览36
- 被引1
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
