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基因组分析揭示陕西中华蜜蜂遗传多样性

Genomic analysis reveals genetic diversity of Apis cerana cerana in Shaanxi

摘要[目的]基于全基因组重测序对陕西及其邻近地区不同地理区位下的中华蜜蜂Apis cerana cerana群体的遗传多样性进行研究,为陕西中华蜜蜂遗传资源的保护和利用提供参考.[方法]对采自陕西西部的49个中华蜜蜂群体样本进行全基因组重测序,结合此前的研究与GenBank公开数据,运用PCA主成分分析、ADMIXTURE群体遗传结构分析、系统发育分析、遗传变异分析等群体遗传学方法进行分析.[结果]群体遗传结构与PCA主成分分析表明,陕西北部高原群体与陕西中部平原、西部平原、西部山地和南部山地群体具有明显的遗传分化;且西部平原与山地群体之间也存在遗传差异.遗传变异分析表明,陕西北部高原群体与陕西其他群体之间的Fst平均值为0.050 9,高于陕西其他地理区位群体之间的Fst平均值0.029 6,并且与西部山地群体具有最小的Fst值0.039 7,同时,在邻近地区中,与太行吕梁群体具有最小的Fst值0.044 3;此外,陕西西部平原群体与神农架林区群体具有最小的Fst值0.022 1;与其他群体相比,陕西西部平原、山地两个群体内部具有相对较高的核酸多态性,分别为0.001 430 62和0.001 483 04,表明它们群体内部相对较高的遗传多样性.系统进化树表明,陕西西部山地群体、陕西北方高原群体与太行吕梁群体具有较近的遗传关系;陕西西部平原群体与神农架林区群体具有较近的遗传关系.[结论]陕西中华蜜蜂不同地理区位之间具有丰富的遗传多样性,且陕西北部高原群体与陕西其他地理区位群体间具有明显的遗传分化;同时根据分析结果推测了陕西中华蜜蜂可能的历史传播路线,分为独立的南、北两条路线.本研究首次从全基因组重测序角度揭示了陕西中华蜜蜂遗传多样性,探明了不同地理区位下的遗传关系,为陕西中华蜜蜂种质资源的保护与利用提供了有力参考.

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作者 刘强 [1] 姜衍 [2] 郭伟 [3] 孙金博 [3] 拜雏波 [3] 卜莉 [3] 张小燕 [2] 学术成果认领
作者单位 陕西省延安市动物疫病预防控制中心,延安 716000 [1] 重庆师范大学生命科学学院,重庆 401331 [2] 陕西省延安市养蜂试验站,延安 716000 [3]
栏目名称 研究论文
DOI 10.7679/j.issn.2095-1353.2024.004
发布时间 2024-06-07
基金项目
重庆市自然科学基金 重庆荣昌农牧高新技术产业研发专项 现代农业产业技术体系建设专项
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应用昆虫学报

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2024年61卷1期

29-36页

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