意大利蜜蜂lncRNA17000的时空表达谱与潜在调控作用
Spatio-temporal expression profile and putative regulatory role of the Apis mellifera ligustica lncRNA17000 gene
摘要[目的]旨在探究lncRNA17000在意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica工蜂不同组织和发育阶段中的表达模式及其调控作用,为进一步的功能和机制研究提供基础.[方法]通过RT-PCR验证lncRNA17000在工蜂不同组织中的表达.采用RT-qPCR检测其不同组织和发育阶段的相对表达量.利用LncTar、Miranda、RNAhybrid和TargetScan等一系列软件分析lncRNA17000的顺式、反式和竞争性内源RNA(Competing endogenous RNA,ceRNA)调控作用.[结果]在工蜂的脑、触角、毒腺、中肠、表皮、咽下腺和脂肪体7个组织中均扩增出符合预期大小(约133 bp)的目的片段.LncRNA17000在上述7个组织中差异表达,在触角中的表达量最高且显著高于(P<0.05)脂肪体中的表达量.LncRNA17000在工蜂的卵、幼虫、预蛹、蛹和成虫中差异表达,在7日龄预蛹中的表达量最高且显著高于(P<0.05)3日龄幼虫、8日龄预蛹和12日龄蛹中的表达量.LncRNA17000在6、12、15和18日龄成虫体内的表达量显著低于(P<0.05)1日龄成虫体内的表达量且表达水平随日龄增长而降低.LncRNA17000潜在调控7个上下游基因的转录和2个共表达基因的表达.LncRNA17000可靶向45个miRNA进而靶向66条mRNA,这些靶mRNA涉及23个GO条目和25条KEGG通路.[结论]LncRNA17000在意大利蜜蜂工蜂的不同组织和发育阶段中动态差异表达,在触角和7日龄预蛹中特异性高表达;lncRNA17000可能通过顺式作用调控TFIID亚基11亚型X2基因转录,通过反式作用调控蜜蜂翼视蛋白基因表达,通过ceRNA网络靶向多个miRNA和mRNA进而影响胰岛素、ErbB和mTOR等信号通路.
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