细粒棘球绦虫AgB1抗原表位的生物信息学预测

Bioinformatics Prediction of AgB1 Antigen Epitopes of Echinococcus granulosus

二维码有效期 120s

摘要以细粒棘球绦虫AgB1基因序列为基础,采用PredictProtein软件预测其编码蛋白的二级结构；应用在线预测软件Bcepred、Abcpred、IEDB及SYFPEITHI等对细粒棘球绦虫AgB1的B细胞表位和T细胞表位进行预测.结果提示,AgB1抗原蛋白存在可以构成抗原表位的区域,经软件分析,分值高的B细胞表位区域:2～9、15～20、22～35和41～52氨基酸序列;T细胞表位区域:3～12、26～33、34～44和52～61氨基酸序列.研究运用生物信息学确定AgB1抗原的4个B细胞优势表位和4个T细胞优势表位,对进一步研究AgB1的抗原性和研发更有价值的免疫诊断方法具有重要意义.

作者马秀敏 ^[1] 胡晓安 ^[1] 阿尔孜古丽·吐尔逊 ^[2] 李艳华 ^[3] 刘学磊 ^[3] 朱明 ^[3] 丁剑冰 ^[3] 学术成果认领

作者单位新疆医科大学第一附属医院,省部共建国家重点实验室培育基地——新疆重大疾病医学重点实验室,乌鲁木齐830054;新疆医科大学基础医学院,乌鲁木齐830011 ^[1] 新疆医科大学第一附属医院,省部共建国家重点实验室培育基地——新疆重大疾病医学重点实验室,乌鲁木齐830054 ^[2] 新疆医科大学基础医学院,乌鲁木齐,830011 ^[3]

关键词 AgB1 B细胞表位 T细胞表位生物信息学 AgB1 B cell epitopes T cell epitopes bioinformatics

分类号 R392

栏目名称

研究论文

DOI 10.3981/j.issn.1000-7857.2013.27.003

发布时间 2013-11-12

基金项目

新疆维吾尔自治区自然科学基金项目（2012211A034）；国家自然科学基金项目（31160194,81260253,30960358）