换一批人轮状病毒非结构蛋白NSP4基因特征的初步分析
Preliminary Analysis of Genetic Characteristics and Variation of the Nonstructural Protein NSP4 of Human Rotavirus Strains
摘要目的:初步了解重症腹泻轮状病毒株NSP4基因特征及变异情况.方法:在2002年100例秋冬季腹泻患儿轮状病毒分子流行特征的研究中,确诊为轮状病毒腹泻的10例患儿的粪便标本,用PCR方法对其NSP4基因进行测定,并挑选出一株重症腹泻轮状病毒毒株(简称02'K1),采用一步法RT-PCR对其NSP4基因进行扩增获得NSP4 cDNA,利用银染测序方法对所扩增获得NSP4 cDNA进行测定.采用Winegene231核酸分析软件对02'K1株NSP4核苷酸序列进行翻译,同时利用Omiga生物软件对02'K1株、ST3株(人轮状病毒G4血清型)及代表NSP4四个主要基因型的之一的Wa株(简称Wa-1株)、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸序列进行比较,分析其同源性及02'K1株的NSP4氨基酸变异位点.结果:(1)经一步法RT-PCR扩增获得的NSP4 cDNA约725 bp,NSP4基因全长686个核苷酸,含有一个开放读码框架,编码一个由175个氨基酸组成的蛋白;(2)02'K1株与ST3株、Wa-1株、Wa-a株、Wa-v株的核苷酸和氨基酸同源性均达90%以上;(3)与ST3比较,02'K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异,即aa16、aa26、aa60、aa72、aa76、aa124、aa135、aa140、aa141、aa 145、aa146、aa161、aa162、aa169.结论:(1)02'K1株的NSP4基因型属于Wa组;(2)02'K1株的NSP4氨基酸序列有14个位点发生了变异.
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DOI
10.3969/j.issn.1003-4706.2004.04.012
发布时间
2005-01-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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