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基于matK+rbcL+trnH-psbA联合分析法对罂粟属的植物鉴定

Identification of Papaveraceae Based on Chloroplast DNA matK+rbcL+ trnH-psbA

摘要目的 利用DNA条形码技术探索罂粟的鉴定方法,寻找可靠的DNA条形码序列对罂粟属植物进行种内和种间的鉴别.方法 采用5种不同种类的虞美人和花菱草作为罂粟鉴别的种内植物、种间植物.利用叶绿体基因组matK、rbcL、trnH-psbA和核糖体基因组ITS2、ITS4、ITS5引物对提取的DNA进行扩增,并双向测序拼接,利用MEGA.X.对序列进行分析比对,计算种内、种间遗传距离,同时使用该软件构建NJ系统发育树.结果 将测序结果录入Genbank中进行比对分析,结果显示单一DNA条形码序列无法有效区分虞美人与罂粟.通过Genbank下载数据使用matK+rbcL+trnH-psbA组合条形码构建系统发育树成功,对罂粟和虞美人样本测序结果进行验证.经验证,matK+rbcL+trnH-psbA组合条形码构建NJ发育树成功,能有效区分虞美人和罂粟.结论 matK+rbcL+trnH-psbA作为组合DNA条形码使用,可以有效鉴别罂粟属内植物.

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作者 范豫杰 [1] 黄磊 [2] 苏世达 [2] 苏少明 [2] 学术成果认领
作者单位 云南省刑事科学技术重点实验室,云南昆明 650221 [1] 昆明市公安局刑事科学技术研究所,云南 昆明 650506 [2]
分类号 DF795.2
栏目名称 基础医学
DOI 10.12259/j.issn.2095-610X.S20230104
发布时间 2023-02-20
基金项目
云南省刑事科学技术重点实验室开放基金资助项目
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