人腮腺区多形性腺瘤中差异表达长链非编码RNA的初步筛选分析
Preliminary screen and analysis of differentially expressed lncRNA in human parotid pleomorphic adenoma
摘要目的:检测人腮腺区多形性腺瘤中差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),并进行初步筛选分析.方法:收集3对人腮腺区多形性腺瘤肿瘤(肿瘤组)和瘤旁标本(对照组),运用高通量lncRNA芯片检测其差异表达的lncRNA,统计分析差异表达lncRNA的数目和分类.通过计算Pearson相关系数,筛选出与PLAG1和CTNNB1共表达的lncRNA,并利用实时荧光定量PCR对其中感兴趣lncRNA的表达进行验证.结果:相较于对照组,共计17 382个lncRNA在人腮腺区多形性腺瘤肿瘤标本中呈现显著差异(上调的8 182个,下调的9 200个),而差异表达lncRNA的主要为自然反义型和基因间型lncRNA(P<0.05).同时筛选出23个与PLAG1和CTNNB1共表达的lncRNA(上调的11个,下调的12个),其中lncRNA ENST00000609511在扩大样本验证中差异无统计学意义(P>0.05),而lncRNA T256768在肿瘤标本中的表达较对照组中明显降低(P<0.05).结论:人腮腺区多形性腺瘤中差异表达的lncRNA T256768可与腮腺区多形性腺瘤的发生发展相关.
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