换一批泛凋亡基因PRKAR1B中rs71518324与非综合征型唇腭裂风险相关
rs71518324 in PRKAR1B was associated with the risk of non-syndromic cleft lip with or without cleft palate
摘要目的 确认泛凋亡是否参与非综合征型唇腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的发生并寻找其中的关键遗传变异和基因.方法 首先收集两阶段人群进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)以确定单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)与NSCL/P的相关性.接着选取泛凋亡基因集并提取SNPs,在一阶段人群中进行质控和基于基因的关联分析以筛选候选SNPs,二阶段样本作为验证.Haploreg、RegulomeDB、ATAC测序的功能注释结合基于连锁不平衡的聚集进一步鉴定关键功能遗传变异和风险基因.最后运用表达数量性状位点(expression quan-titative trait loci,eQTL)分析、RNA测序、单细胞测序和蛋白质互作分析预测位点和基因的调控效应.结果 rs71518324与NSCL/P的发病风险相关(Pmeta＜0.001),所在区域富集了大量活性功能元件标志物.rs71518324对PRKAR1B基因的eQTL效应显著(P＜0.001).在RNA测序中PRKAR1B在颅颌面的表达随胚胎发育而增加.在单细胞RNA测序中识别了 5个细胞簇,PRKAR1B主要定位于外胚层.结论 泛凋亡相关基因PRKAR1B中的rs71518324与NSCL/P风险显著相关.
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分类号
R783.5（口腔矫形学）
栏目名称
DOI
10.13591/j.cnki.kqyx.2025.07.002
发布时间
2025-08-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82270946）
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