小鼠牙胚发育过程中细胞骨架分子表达谱的变化和特征分析
Changes and Characteristics Analysis of Cytoskeleton Molecular Expression Profiles during Mouse Tooth Embryo Devel-opment
摘要目的:细胞骨架在牙胚发育中发挥关键作用,本研究通过整合转录组测序与生物信息学分析技术,探究小鼠牙胚不同发育时期细胞骨架相关分子的表达特征.方法:采用出生后1.5 d的C57BL/6小鼠,体式显微镜下分离磨牙牙胚,提取总RNA进行转录组测序,并从GEO数据库(GSE255946)获取小鼠胚胎期14.5 d及16.5 d的牙胚转录组数据.比较牙胚发育在帽状期、钟状早期和钟状晚期时细胞骨架相关基因的表达变化,筛选差异表达基因.结果:在牙胚的发育进程中,微丝、微管和中间丝3种骨架成分呈现动态表达变化.从帽状期至钟状早期15个基因表达显著上调,6个基因表达下调;从钟状早期至钟状晚期 3个基因表达上调,4个基因表达下调.结论:细胞骨架相关分子在牙胚中呈现高丰度表达特征,其动态变化与牙胚生长发育进程展现出高度协同的表达模式,参与调控牙胚形态发生和细胞分化.未来研究重点可聚焦牙胚中每百万映射片段上的每千碱基转录本片段数(frag-ments per kilobase of transcript per million fragments mapped,FPKM)值较高且功能尚未阐明的分子.
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