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基于矩阵填充的肿瘤基因表达谱数据缺失点估计

Tumor Gene Expression Missing Value Estimation Based on Matrix Completion

摘要为解决肿瘤基因表达谱数据后续研究需要完整数据矩阵的问题,针对包含缺失点的数据集.提出基于矩阵填充(matrix completion)与模糊C均值(fuzzy c-means algorithm,FCM)相结合的缺失点估计方法(FCM_MC).该方法充分利用肿瘤基因表达谱数据的冗余信息,通过模糊C均值聚类得到具有良好的低秩特性的基因语义片段,再利用矩阵填充方法分别对每个语义片段进行缺失点的重建.在不同数据集上进行实验,与传统缺失点估计算法比较.实验表明FCM_MC算法在缺失数据估计准确度和类结构保持度上效果得到有效提升,同时运行效率较高.

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分类号 TP301.6
栏目名称
DOI 10.3969/j.issn.1671-1815.2017.07.011
发布时间 2017-05-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
基金项目
国家自然科学基金(51365017,61305019); 江西省教育厅科技计划(GJJ150680)
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