基于网络药理学与分子对接探讨脉络通颗粒治疗心绞痛的作用机制
Potential Mechanism of Mailuotong Granules in Treating Angina Pectoris Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
摘要运用网络药理学分析脉络通颗粒治疗心绞痛的机制,并通过分子对接进行验证.在中药系统药理学平台TCMSP数据库中检索脉络通颗粒药物活性成分筛选靶基因;以"Angina Pectoris"为关键词在Genecards、OMIM数据库中检索疾病相关基因;将脉络通颗粒的活性成分靶点与心绞痛疾病靶点的交集作为关键靶点;利用STRING数据库构建蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI);用Cytoscape 3.10.2软件构建脉络通颗粒-活性成分-潜在靶点网络;运用David数据库、微生信网站进行GO分析和KEGG富集分析.应用Pymol、AutoDock Tools等软件对核心成分与关键靶点进行分子对接的验证,并利用Pymol进行可视化分析.结果表明:脉络通颗粒有118个有效活性成分,544个靶点;心绞痛靶基因1 297个,药物-疾病共同基因176个,筛选血清半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(caspase-3,CASP3)、前列腺素内过氧化物合成酶2(prostaglandin-endoperoxide syn-thase 2,PTGS2)、血清基质金属蛋白酶 9(matrix metalloproteinase 9,MMP9)、白介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)5个关键基因,GO功能富集分析和KEGG通路富集分析主要富集在糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(advanced glycation end products-receptor of advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化(fluid shear stress and atherosclerosis)等.将山柰酚(kaempferol)、柄花素(formononetin)、槲皮素(quercetin)、异鼠李素(isorhamnetin)、木犀草素(luteolin)分别作用于血清半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3、前列腺素内过氧化物合成酶2、血清基质金属蛋白9、白介素-6、肿瘤坏死因子进行分子对接,结果显示木犀草素、山柰酚、异鼠李素、柄花素与CASP3、IL-6、PTGS2、TNF、MMP9均具有较强的结合活性.脉络通颗粒能够通过槲皮素、木犀草素等成分作用于血清半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3、前列腺素内过氧化物合成酶2、血清基质金属蛋白酶9等核心靶点,调控流体剪切应力和动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路等生物学途径,抑制内皮细胞增生,控制炎症反应,抗氧化应激,参与机体代谢治疗心绞痛.
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