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首页 > 科学通报 > 表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析

表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析

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摘要应用序列同源性比较及功能域分析等生物信息学手段, 从表皮葡萄球菌全基因组序列中发现16对双组分调控系统以及2个相对保守的功能域(HATPase_c和REC). 通过与金黄色葡萄球菌和枯草杆菌中的双组分调控系统基因比较, 预测表皮葡萄球菌中同源双组分调控系统基因可能具有参与调控细菌生长、生物膜形成、毒力因子表达等重要生物学功能. 对16对双组分调控系统基因的2个保守性功能域进行空间结构模建, 获得4个相似的组氨酸蛋白激酶HATPase_c功能域模拟结构以及13个相似的反应调节蛋白REC功能域模拟结构, 其中HATPase_c结构在AMP-PNP的结合部位形成袋状结构, 而REC结构中均包含3个天冬氨酸活性位点. 初步实验结果表明表皮葡萄球菌双组分调控系统保守性功能域的生物信息学分析可以为进一步开发相关治疗药物提供潜在的靶标.

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作者 秦智强 [1] 钟扬 [2] 张健 [3] 何有裕 [4] 吴旸 [1] 江娟 [1] 陈洁敏 [1] 罗小民 [3] 瞿涤 [1] 学术成果认领
作者单位 复旦大学医学院教育部卫生部分子病毒重点实验室,上海,200032 [1] 复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部,重点实验室,上海,200433;上海生物信息技术研究中心,上海,200235 [2] 中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心,上海,201203 [3] 中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心,上海,200031 [4]
关键词 表皮葡萄球菌双组分调控系统组氨酸蛋白激酶反应调节蛋白生物信息学药物靶标
分类号 R3（基础医学）
栏目名称
论文
DOI 10.3321/j.issn:0023-074X.2004.10.007
发布时间 2004-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家高技术研究发展计划（863计划）（2001AA223011） 国家重点基础研究发展计划（973计划）（2002CB5128） 上海市科技发展项目（02DJ14002）
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