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液相芯片技术联合等位基因特异性引物延伸反应检测结核分枝杆菌耐多药突变

Detection of multidrug-resistant Mycobacterium Tuberculosis by suspension array technology and allele-specific primer extension reaction

摘要目的 建立一种耐多药结核分枝杆菌检测方法.方法 设计并构建含有katG315、rpoB526、rpoB531耐药基因突变位点的质粒;通过PCR扩增及纯化、等位基因特异性引物延伸反应(ASPE)、荧光微球杂交反应及液相芯片系统Luminex 200检测;并对该方法反应条件进行探索及方法学评价.结果 ASPE反应中Tsp DNA聚合酶最适浓度为0.025U/μL,杂交荧光微球浓度为每μL 100个,链霉亲和素藻红蛋白浓度及杂交时间分别为2μg/mL和20 min;所建立方法的检测灵敏度最低可达1ng/mL;当质粒浓度为1.5×105 ng/mL时,批间和批内变异系数(CV)分别为6.48%~12.15%和0.35% ~6.92%;当质粒浓度为2 ng/mL时,批间和批内变异系数(CV)分别为5.73% ~ 10.77%和0.97% ~ 8.91%;特异性引物探针与其他突变位点均无交叉反应.结论 液相芯片技术联合等位基因特异性引物延伸反应检测耐多药结核分枝杆菌灵敏且具有成本低、高通量等特点,极具临床应用潜力.

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