换一批基于单细胞测序探索乙型肝炎患者树突状细胞的功能变化
Single-cell sequencing reveals functional changes of dendritic cells in hepatitis B patients
摘要目的 探讨乙型肝炎病毒(HBV)感染不同阶段患者树突状细胞(DC)功能变化,并分析其功能障碍机制.方法 从GEO数据库下载单细胞RNA测序数据集GSE182159,根据感染阶段分为健康对照(HC)组、免疫活动(IA)组和免疫耐受(IT)组.选取IA和IT患者各 7 例以及同期 12 例体检健康者采集外周血,使用流式细胞术筛选经典树突状细胞(cDC)和浆细胞样树突状细胞(pDC),实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测cDC和pDC转录因子表达水平.使用R语言和Python语言进行生物信息学分析.结果 IA组和IT组的DC占比高于HC组.功能富集分析显示,IA组cDC的差异基因主要富集于炎症反应、MHCⅡ抗原加工与提呈、细胞迁移、信号传递、代谢及免疫反应,IT组富集强度较低且干扰素反应显著下降.IA组pDC差异基因富集于MHCⅡ抗原提呈、Fc受体信号转导和代谢,而IT组仅富集于Fc受体信号转导及代谢,且强度更低.两组pDC对Ⅰ、Ⅱ型干扰素的合成均下调,IT组下调更为显著.细胞通信分析显示,IA组髓系细胞除pDC外,与T细胞的通信增强;IT组cDC和pDC与T细胞的通信则下降.转录因子分析发现,STAT2、STAT3、IRF1、IRF5 在IA组高表达,而在IT组表达较低;BHL-HE40 在IT组cDC和pDC中普遍高表达.qRT-PCR结果与单细胞转录因子分析结果一致.结论 乙型肝炎IT期是cDC功能障碍的关键时期,其MHCⅡ抗原提呈、代谢及干扰素反应被显著抑制.pDC功能抑制较cDC更早发生,在IA期即表现出干扰素合成能力显著下调.
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