3种基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱系统对洋葱伯克霍尔德菌复合群鉴定准确性的评估
Evaluation of the accuracy of three kinds of matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry sys-tems in the identification of Burkholderia cepacia complex
摘要目的 比较 3 种品牌基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定洋葱伯克霍尔德菌复合群(Bcc)的准确性.方法 收集 2019 年 1 月至 2024 年 1 月浙江大学医学院附属第一医院临床分离的Bcc,采用管家基因hisA测序作为金标准,比较 3 种MALDI-TOF MS鉴定菌种的能力.结果 共收集 386 株Bcc,Bruker Biotyper、Autof ms1000 和Vitek MS对Bcc在种水平的鉴定准确率分别为 91.19%、91.79%和 98.96%,Biotyper和Autof ms1000 差异无统计学意义(χ2=0.151,P=0.679),而Vitek MS与Autof ms1000、Vitek MS 与 Biotyper 两组数据之间差异有统计学意义(χ2=21.818,P<0.001;χ2=24.910,P<0.001).不同菌种间,3 种MALDI-TOF MS系统对多食伯克霍尔德菌的鉴定结果准确率均大于 99%,差异无统计学意义,而对于新洋葱伯克霍尔德菌Biotyper和Vitek MS的鉴定准确率(98.3%和98.8%)高于Autof ms1000(88.7%),两组数据差异有统计学意义(χ2=13.438,P<0.001;χ2=15.703,P<0.001).Biotyper数据库中不包含污染伯克霍尔德菌,无法将其鉴定至种,Vitek MS对污染伯克霍尔德菌的鉴定准确率(96.2%)高于Autof ms1000(74.0%).结论 3 种MALDI-TOF MS系统对Bcc鉴定的准确性各有差异,Vitek MS优于Biotyper和Autof ms1000.
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