MALDI-TOF MS鉴定诺卡菌不同前处理方法结果比较
Comparison of different pretreatment methods for Nocardia identification by MALDI-TOF MS
摘要目的 探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF MS)鉴定诺卡菌最优前处理方法.方法 对临床分离的 93 株诺卡菌应用 MALDI-TOF MS 进行鉴定,采用双甲酸法、玻璃珠震荡-甲酸-乙腈法、原位甲酸法 3 种不同前处理方法,以 16S rRNA、secA1 基因测序为参考方法进行结果评价.运用 Kappa 统计量进行统计学一致性分析.结果 93 株诺卡菌中,91 株(97.8%)经双甲酸法鉴定至种,88 株(94.6%)经玻璃珠震荡-甲酸-乙腈法鉴定至种,而只有 64 株(68.8%)经原位甲酸法鉴定至种;与基因测序相比,种鉴定能力 Kappa 值分别为 0.975、0.936、0.652.对于脓肿诺卡菌复合群,双甲酸法、玻璃珠震荡-甲酸-乙腈法、原位甲酸法 3 种方法鉴定至种的准确率分别为 95.5%(21/22)、86.4%(19/22)、36.4%(8/22),与基因测序相比,Kappa值分别为 0.900、0.730、0.251.结论 双甲酸法操作简单、快速,鉴定准确率高.对于脓肿诺卡菌复合群,双甲酸法鉴定准确性优于玻璃珠震荡-甲酸-乙腈法.推荐在 MALDI-TOF MS 鉴定诺卡菌中采用双甲酸法进行前处理.
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