换一批储存红细胞中表达降低的circRNA以及其靶基因预测的研究
Study on Decreased Expression of CircRNAs in Stored Erythrocytes and Their Target Genes Prediction
摘要目的 探讨储存红细胞中表达降低的circRNA靶基因预测及其与储存损伤的关系.方法 3(人)份血样来自健康无偿献血者血液制备的悬浮红细胞,滤除白细胞后均分为新鲜组(0 d),4℃储存20 d红细胞组(储存组);对2组标本用高通量测序检测,选取下降明显的10个circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析,以此筛选到可能与储存损伤密切相关的circRNA.结果 20 d与0 d组对比,hsa_circ_0005413、hsa_circ_0008937、hsa_circ_0040340、hsa_circ_0003126、hsa_circ_0007995、hsa_circ_0023937、novel_circ_0000402、hsa_circ_0028281表达量显著下降(P<0.05);hsa-miR-7160-5p、hsa-miR-122-5p、hsa-miR-4534的表达量显著上升(P<0.05);CASP8、CDK4、TMOD3显著下降(P<0.05).生物信息学分析显示这些circRNA的靶基因参与红细胞凋亡与抗凋亡、红细胞膜的稳定、红细胞氧化损伤、铁代谢等生理过程.结论 本研究构建了几个差异表达的circRNA-miRNA-mRNA网络,发现hsa_circ_0005413-hsa-miR-7160-5p-CASP8、hsa_circ_0040340-hsa-miR-122-5p-CDK4、hsa_circ_0007995-hsa-miR-4534-TMOD3可能参与了红细胞储存损伤的生物学过程.
更多相关知识
- 浏览61
- 被引0
- 下载16
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
