换一批基于公共数据库的结肠腺癌中DNA甲基化调控SLC35D1表达及临床意义
Analysis of SLC35D1 Expression Level Regulated by DNA Methylation in Colon Adenocarcinoma Based on Public Databases and Its Clinical Signifi-cance
摘要目的 探讨结肠腺癌中DNA甲基化调控SLC35D1 表达及与预后的关系.方法 从癌症基因组图集(TCGA)数据库下载结肠腺癌的表达和甲基化数据,分析SLC35D1 在结肠腺癌组织和正常组织的表达和甲基化情况,同时从基因表达数据库下载结肠腺癌的表达和甲基化数据进行验证.利用Kaplan-Meier方法分析SLC35D1 对结肠腺癌患者预后的影响,构建患者列线图模型,对SLC35D1 及共表达基因进行功能富集分析,分析SLC35D1 表达与肿瘤浸润免疫细胞的关系,验证SLC35D1 启动子甲基化转录沉默关系.结果 SLC35D1 在结肠腺癌组织中表达低于正常组织(P<0.01).结肠腺癌组织中SLC35D1 甲基化程度高于正常组织(P<0.01).SLC35D1 低表达患者的总生存率低于高表达患者(P<0.05).联合SLC35D1 表达、年龄和TNM分期构建的列线图模型能够高效地预测结肠腺癌患者的预后.SLC35D1 表达水平改变与肿瘤免疫微环境相关.qRCP结果显示,在结直肠癌细胞SW480 中SLC35D1 低表达,经过DNA甲基化转移酶抑制剂处理后SLC35D1 表达恢复(P<0.05).结论 在结肠腺癌中SLC35D1 低表达受其甲基化调控,是患者不良预后标志物,其可能通过MAPK通路和影响肿瘤免疫微环境调控结肠腺癌的进展.
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关键词
结肠肿瘤腺癌SLC35D1DNA甲基化预后列线图肿瘤微环境Colon neoplasmsAdenocarcinomaSLC35D1DNA methylationPrognosisNomogramsTumor mi-croenvironment
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1002-3429.2024.18.008
发布时间
2024-11-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点研发计划（2022YFF0710300）
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