Rho GTP酶激活蛋白9在肾透明细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析
Bioinformatics analysis of the expression and clinical significance of Rho GTPase activating protein 9 in kidney clear cell carcinoma
摘要目的 探讨Rho GTP酶激活蛋白9(ARHGAP9)在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达、临床预后价值及与免疫细胞浸润的相关性.方法 基于癌症基因组图谱计划数据库及临床样本验证,比较ARHGAP9在KIRC肿瘤组织与正常组织中的表达差异.通过分层分析,探讨ARHGAP9表达水平及其DNA启动子甲基化状态与患者临床病理特征的关系.利用检索相互作用的基因/蛋白质的搜索工具平台构建ARHGAP9的蛋白互作网络,并对互作基因进行京都基因与基因组百科全书通路富集分析.进一步应用肿瘤免疫评估资源数据库算法,评估ARHGAP9表达与肿瘤微环境中免疫细胞浸润水平的关联.结合Cox比例风险回归模型,评估ARHGAP9表达及关键免疫细胞浸润对KIRC患者预后的独立预测价值.结果 ARHGAP9在多种肿瘤中差异表达并与患者预后相关(P<0.05).ARHGAP9的mRNA和蛋白表达水平在KIRC中上调(P<0.05).KIRC中ARHGAP9的mRNA和蛋白表达以及DNA启动子的甲基化水平与组织学分级、TNM分期和淋巴结分期有关(P<0.05).功能富集分析结果表明,ARHGAP9参与调节鞘脂信号通路、环磷酸腺苷信号通路、Ras信号通路以及Wnt信号通路.ARHGAP9的表达与CD4+T细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、树突状细胞、B细胞和巨噬细胞的浸润水平相关(P<0.05).单因素和多因素Cox回归分析显示,ARHGAP9高表达是KIRC患者预后的独立危险因素.结论 ARHGAP9在KIRC中高表达并与不良预后相关,可能作为KIRC患者预后的可靠生物标志物和治疗的潜在靶点.
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