换一批转录组学联合机器学习探讨视神经脊髓炎谱系疾病铁死亡相关治疗靶点
Transcriptomics combined with machine learning to explore ferroptosis-related therapeutic targets in neuromyelitis optica spectrum disorder
摘要目的 探讨视神经脊髓炎谱系疾病(NMOSD)铁死亡相关分子靶点.方法 下载并合并GEO数据库中的 2 个NMOSD相关数据集(GSE98784 和GSE235276),确定与铁死亡相关的关键基因.分析关键基因功能及影响疾病进展的潜在分子通路,并对潜在干预药物进行分子结构的预测.结果 通过最小绝对收缩和选择算子回归、支持向量机及随机森林筛选出在视神经脊髓炎中的特征基因,筛选出3 个交集基因,分别为Cp、Ctsb、Il1b.基因集富集分析、基因集变异分析表明,这些基因可能通过参与氧化应激、氧化磷酸化、免疫与炎症相关分子通路影响疾病的进展.关键基因表达水平与疾病调控基因表达水平显著相关,其中,Cp、Ctsb、Il1b均与Cxcl13 呈较高的相关性.对关键基因的受试者工作特征曲线分析显示,Cp、Ctsb、Il1b均具有极高的曲线下面积(均为1.000),即这些基因能够在疾病预测中提供高度的敏感性和特异性.DGIdb检索发现,4 种药物与Ctsb相互作用,27 种药物与Cp相互作用,51 种药物与Il1b相互作用.对关键基因进行分子对接,关键基因选择的蛋白及化合物为Ctsb:P07858-Q4UG565ZYH、Il1b:P01584-TT-301.结论 铁死亡相关通路可能参与NMOSD的发病机制,Cp、Ctsb、Il1b基因可能成为抑制NMOSD小胶质细胞铁死亡、改善NMOSD患者预后的潜在靶点.
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关键词
视神经脊髓炎谱系疾病铁死亡关键基因治疗靶点Neuromyelitis optica spectrum disorderIron deathKey genesTherapeutic targets
分类号
R744（神经病学与精神病学）
栏目名称
DOI
10.16680/j.1671-3826.2026.01.07
发布时间
2026-02-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
辽宁省博士启动基金（2022-BS-034）
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