中药黄连治疗表皮生长因子受体突变肺腺癌奥希替尼耐药关键发病机制及其潜在干预靶点
Exploring the key pathogenic mechanisms and potential intervention targets of Coptis chinensis in treating epidermal growth factor receptor-mutant lung adenocarcinoma with osimertinib resistance
摘要目的 探讨中药黄连治疗表皮生长因子受体(EGFR)突变肺腺癌奥希替尼耐药的分子靶标及相关作用机制.方法 使用TCMSP平台按照类药性≥0.18 和口服生物利用度≥30%筛选中药黄连的有效成分.从DrugBank数据库筛选出有效化合物的靶标基因.从 GEO 数据库筛选包含 EGFR 突变的肺腺癌奥希替尼耐药和敏感组差异表达基因数据集(GSE163913).借助GEO数据库的基因表达分析工具,以|log FC|>1.5 及P<0.05 为标准筛选数据库中的差异表达基因.构建韦恩图得到最终的候选作用靶点基因.在TCGA数据库中验证关键基因的表达及其与肺腺癌患者预后的相关性.在GeneMania数据库和STRING数据库中构建蛋白基因互作网络.在Pubchem数据库、蛋白质数据库和CB-DOCK2 数据库中实现分子对接.采用GSEA富集分析探讨可能的作用机制.结果 在TCMSP数据库中发现中药黄连中含有 10 种有效化合物,181 个不同的靶基因.从GEO数据库中GSE163913 数据集获得的EGFR突变的肺腺癌奥希替尼耐药差异表达基因共328 个.韦恩图构建最终得到1 个共同的差异基因,为ALOX5.ALOX5 在肺腺癌肿瘤组织中表达下调.ALOX5 高表达患者疾病特异生存期长于ALOX5 低表达患者,差异有统计学意义(P<0.05).分子对接显示,ALOX5 和quercetin(槲皮素)的亲和力为-8.8.GSEA功能分析发现,ALOX5 通过影响肿瘤免疫微环境、细胞因子和炎症反应、RAS信号通路、DNA甲基化、DNA复制、细胞凋亡、Egfegfr信号通路、糖代谢、组氨酸和精氨酸的甲基化影响肺腺癌的不同生物学事件.结论 ALOX5 表达上调可以改善肺腺癌患者的预后,能够用作肺腺癌患者的预测性生物标志物.中药黄连可能靶向促进ALOX5 的表达并多通路途径发挥了治疗EGFR突变肺腺癌奥希替尼耐药的作用.
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