换一批基于对枸杞、姜黄、甘草的生物信息学分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治疗意义
To explore the therapeutic significance of GRIN3A in prostate cancer based on bioinformatics analysis of medlar, turmeric and liquorice
摘要目的 综合分析枸杞、姜黄、甘草在前列腺癌中的治疗作用,发掘新的靶向治疗基因.方法 BATMAN-TCM数据库预测3类药材靶向蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因.在Cytoscape中选择候选核心基因,通过生存分析确定最终核心基因.对核心基因进行单基因GSEA分析以及COX回归分析.结果 3类药材共同靶向基因180个,其中在TCGA数据库前列腺肿瘤组织与正常组织间差异表达的基因有11个.Cytoscape中筛选出候选差异基因PTGS2、GRIN3A、CACNAID.生存分析显示,仅GIN3A与患者不良预后相关.单基因GSEA提示,GRIN3A相关的生物学活动对前列腺癌的发生发展具有促进作用.单因素及多因素COX回归提示,GRIN3A为疾病的独立预后因素.结论 GRIN3A在枸杞、姜黄、甘草对前列腺癌的治疗机制中发挥重要作用,该基因具有成为前列腺癌靶向治疗位点的潜能.
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DOI
10.14053/j.cnki.ppcr.202001004
发布时间
2020-06-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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