老年血流感染患者分离鲍曼不动杆菌全基因组分析
Whole genome analysis of Acinetobacter baumannii isolated from an elderly patient with bloodstream infections
摘要目的 对老年患者血培养分离的广泛耐药鲍曼不动杆菌行全基因组测序及毒力和耐药基因分析.方法 2023年1月从一例老年重症肺炎患者的血培养标本中分离XDR鲍曼不动杆菌AB_HD1,进行鉴定和药敏试验,采用二代+三代测序技术进行细菌全基因组测序,再通过生物信息学方法进行质控、组装和分析.结果 菌株组装出一个染色体和3个质粒,全基因组的可移动元件包含17个基因组岛、6个前噬菌体、1个整合子、7个插入序列和7个转座子.该菌株的MLST分型为ST208,药敏实验提示,除多黏菌素敏感外,该菌对临床常用抗菌素包括β内酰胺类、喹诺酮类、大环内酯类、四环素类、氨基糖苷类、磺胺类抗菌药物等均耐药.AB-HD1菌株有3个耐药基因组岛,耐药基因分析包括blaADC-25、blaOXA-66、blaTEM-1D、blaOXA-23、armA、aadA1、aac(6′)-Ib3、aph(3′)-Ia、aac(3)-Ia、aadA24、aph(3″)-Ib、aph(6)-Id、mph(E)、msr(E)、catB8、sul1、tet(B)、qacE、gyrA突变.它的毒力基因参与粘附、生物膜形成、营养摄取、毒素、免疫逃逸因子、双组分调控系统、分泌效应蛋白杀伤宿主细胞.通过SNP系统进化树分析发现特定进化分支的菌株携带共同的耐药基因.结论 鲍曼不动杆菌基因组有较高的可塑性,耐药基因周围有插入序列、转座酶、整合酶基因,其可通过水平转移和基因组重组获取外源遗传信息.针对携带特定耐药基因的进化分支,需加强感染防控措施.
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